Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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