Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms