Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC3Q15034 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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