Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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