Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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