Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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