Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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