Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms