Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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IFT88Q13099 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFT88Q13099 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IFT88Q13099 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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