Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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