Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFFO1Q0D2I5 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms