Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms