Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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RFXAPO00287 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RFXAPO00287 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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