Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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