Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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