Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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