Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms