Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms