Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GABRA6Q16445 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GABRA6Q16445 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms