Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNA6Q15825 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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