Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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