Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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