Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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