Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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UBE4AQ14139 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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