Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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