Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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