Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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