Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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