Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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RESTQ13127 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RESTQ13127 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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