Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFT88Q13099 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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IFT88Q13099 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IFT88Q13099 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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IFT88Q13099 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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IFT88Q13099 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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IFT88Q13099 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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IFT88Q13099 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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IFT88Q13099 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFT88Q13099 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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