Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPRL3Q12980 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms