Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL2Q05D32 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL2Q05D32 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL2Q05D32 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL2Q05D32 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL2Q05D32 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL2Q05D32 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTDSPL2Q05D32 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms