Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CRXO43186 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CRXO43186 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CRXO43186 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms