Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
J3KRW8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
J3KRW8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
J3KRW8 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
J3KRW8 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
J3KRW8 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
J3KRW8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
J3KRW8 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
J3KRW8 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms