Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SH3BP1Q9Y3L3 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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