Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms