Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms