Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL796P-201ENST00000613991 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF322-202ENST00000456172 4718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 THBS3-211ENST00000541990 2928 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113189.6-201ENST00000636696 3591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf131-202ENST00000354479 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.3 ms