Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPOCK3Q9BQ16 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms