Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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