Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMIEQ8NEW7 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms