Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms