Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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ANKRD39Q53RE8 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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