Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C4orf17Q53FE4 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms