Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms