Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
FOXD1Q16676 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms