Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NRF1Q16656 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NRF1Q16656 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms