Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA4Q16363 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA4Q16363 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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