Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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