Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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CBFBQ13951 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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CBFBQ13951 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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