Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1SQ13698 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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